Если у вас есть настроенный «под себя» total commander, но настройки не цепляются то можно создать ярлык и в нем указать путь до места хранения настроек (wincmd.ini):
Для х64 версии, и если файл настроек лежит в папке с программой:
C:\totalcmd\totalcmd64.exe I=.\wincmd.ini
или
C:\totalcmd\totalcmd64.exe I=d:\soft\wincmd.ini